设立暗部为了巩固领导核心的权威，扉间建立了暗部，暗部的成员都是扉间从村子里筛选出的优秀忍者，主要进行保护火影和预防外敌侵入木叶的工作，有时还负责侦察敌情和暗杀等任务，其成员行动时都戴着模仿动物的白色面具，任务性质及其他一切资料均保密。

暗部由火影直属，部队底下设多个分队，由分队长统一传达命令和领导执行任务。 在第二代火影的时代，千手扉间培养出以“虎”、“爆”、“牛”为代表的大量暗部成员。

设立警务部 漫画图片 为了防止下一个斑出现，千手扉间决定整合与引导宇智波的力量，他将警务部与监狱建在一起，让宇智波一族负责维护村子的治安，使宇智波一族为村子做贡献。 然而二代在创立木叶警务部后，一部分继承斑意志的宇智波族人企图造反，扉间派出以“虎”、“爆”、“牛”为代表的大量暗部成员将造反闹事的人逮捕，并令暗部成员监视宇智波族人。

在第二代火影的时代，千手扉间培养出不少像宇智波镜那样，愿意跳出家族的局限，为村子呕心沥血的宇智波族人。 扉间的本意并非隔离宇智波，而是为各家族考虑，也就是无论哪个家族，只要是可能威胁到村子的，扉间都会留意，仅此而已。

但后人误解二代的本意，他们认为二代很讨厌宇智波。 引领新一代 漫画图片 为了保护忍者的孩子们不用再上战场，以及确保教育稳定性和人才培养效率，第二代火影扉间建立了木叶忍者学校，让他们能体会到学习以及玩耍的感觉，并且成长到可以品尝美酒滋味的年龄。

在第二代火影的时代，扉间培育了猿飞日斩、志村团藏、宇智波镜、秋道取风、水户门炎、转寝小春、古介等38名毕业生。而扉间的这些学生也是木叶当时最核心的一批人。 平时执行任务时扉间让学生们以两人为一组的形式组成搭档一起行动。

数十年过后，扉间的六个学生也一个个逐渐长大成青年，与此同时，扉间也年已花甲进入了老年时期。 保护后辈 第一次忍界大战 在第一次忍界大战中，金角银角在雷影与火影的结盟仪式上突然掀起政变。二人以六道忍具和九尾查克拉的力量，让第二代雷影和第二代火影受到了濒临死亡的重伤。

之后，扉间与部下猿飞日斩、水户门炎、转寝小春、志村团藏、秋道取风、宇智波镜一同被大约有20人的金角部队追击，众人商量需要让其中一个人担当诱饵来引诱敌军，以保证其他队友能够有时间顺利逃脱。扉间为选择正确的继承人而暗中考验着部下。团藏虽然抱持着想要自告奋勇担当诱饵的心念，但在关键时刻却因胆怯而没有说出。此时日斩挺身而出，提出让自己担当诱饵。

最终扉间为了木叶隐村的未来而决定亲自担当诱饵，临行前对日斩的行为表示赞许，并授命日斩成为下一代的火影，之后便因掩护日斩等人而牺牲。

中忍考试 中忍考试篇，与柱间一同被复活 在木叶毁灭行动中，扉间与哥哥柱间一同被大蛇丸以秽土转生的形式复活，他们的意志被完全抹杀，被迫参加战斗，二人无法发挥原本的实力。 在战斗过程中，扉间使用水遁忍术与猿飞日斩展开激烈的战斗，由于两人是秽土身躯拥有不死身，所以只能用封印术，或用武力禁锢他们的动作，于是三代火影使用尸鬼封尽将两位火影的灵魂和大蛇丸的双手一同封印，自己也因此牺牲。

忍界大战 在第四次忍界大战中，大蛇丸获取漩涡一族收纳堂的死神面具，切开腹部释放了被死神吞掉的灵魂，恢复了双手，利用佐助体内的四个白绝分身作为活体祭品，以秽土转生的形式复活了历代火影，期间扉间发动怪力爆发出强大的空气流与蓝色的查克拉恐吓佐助、重吾、水月、大蛇丸，连墙壁都被击碎。之后扉间本想解除秽土转生的控制，但大蛇丸通过柱间细胞加强操控，使扉间无法摆脱。

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期间为佐助讲述了宇智波的本质，虽然秽土之身的扉间未能完全展现全盛时期的实力，但仍能够隔空将墙壁击碎，其实力强大由此可见。

扉间奔赴战场后，与其他三位火影联合发动四赤阳阵封住十尾；而此时的十尾释放出一颗尾兽玉，企图破坏结界，二代火影扉间清楚这招的底细，所以并不担心结界被尾兽玉打破，而是冷静的说声我瞧瞧。之后十尾自食苦果了尾兽玉。

随后扉间自豪的笑了，因为与二代火影扉间生前对战的宇智波忍者相比，二代火影从没见过这样强力的加具土命，因此，二代火影分析出这是用比例几乎完全相同的查克拉混合而成的忍术，就算长年的搭档也很难做到。 漫画图片 此时带土已被斑的查克拉操控，初代火影与二代火影因需维持结界来不及赶到带土那边，于是兄弟二人打算靠分身前去阻止斑操控带土使用轮回转世术，然而在维持四赤阳阵的情况下分身的数量会严重减少，因此使扉间只分出了两个影分身，二代火影意识到自己的力量竟会被被削弱到这种程度，但为了阻止斑就算数量少也只能上了，随后扉间的两个影分身奔向斑来到来到斑的面前。

而此时，四代使用三叉式苦无砍伤带土，斑的轮回天生发动也因此失败，二代火影分析出四代这是事先就在带土身上做了标记。 漫画图片 此时带土使用六道十尾柩印将十尾吸收在自己的体内，形成球体状，紧接着球体破碎。带土成功变成十尾人柱力，打破了柱间的明神门，利用背后红色的火焰形成的手扯碎了四赤阳阵，由于之间扉间集中在本体的力量太多了，所以站在斑面前的两个影分身也因此而消失。