因为这件事不怎么光彩，万一暴露很有可能引起国际纠纷，所以根部成员不从木叶村招募，而是由自来也的后花园抚子村以及玄武的私人基地草忍村、泷忍村和鬼灯城出。

根部首领是自来也，所收集到的情报由他统一接受，再传给水门。

这样一来好处多多。

根部没有木叶成员，就不用担心像以前的根部那样尾大不掉，严重分散村子内部力量。

万一根的人暴露，敌国就算查也查不到木叶这里，这样既不影响村子形象，又不怕对方得到村子内部情报，两全其美。

当水门有什么脏活累活不方便村内人处理时，可以交给根部。

第四，重新成立木叶警备部队。

宇智波被灭族的这些年，村子内部治安明显变差，平民们的日常生活受到很大影响。

猿飞日斩因为要备战三战才没有腾出手处理，现在三战打完了，恢复村子稳定必须提上日程。

新木叶警备部部长由宇智波富岳担任，毕竟他以前干过，对这些业务还挺熟的。

警备部规模两百人，分为四个大队，每队负责木叶四分之一区域，成员全部从平民忍者中选取，也算是给平民忍者一个晋升空间。

第五，就是废除以前的空中部队和武装部队编制，成立科技合成部队，直属火影，任何人不得私自调动。

科技合成部队总计人数两千七百人，分为研发部、航空部、海洋部和陆地部。

研发部两百人，由原木叶科研院组成（千手仙草当上大名时特批的由玄武和大蛇丸负责的部门，但是由于猿飞日斩的从中作梗，本来用于研发的经费被以各种名义挪用，因此基本名存实亡，到今天才正式落实），负责新式武器研发。

航空部一千人，这没啥好说的，一千个鸟人。

陆地部一千五百人，其中包括五个火箭营，五个坦克营，五个护卫营。

海洋部队吧，目前没人，还是个空壳子。

该部队第一任总队长由奈良鹿久担任，两名副队长由秋道丁座和山中亥一担任。

此外，因为科技合成部队涉及到大量装备研发、生产和保养问题，所需经费实在太过庞大，木叶根本出不起，故由火之国大名承担一半。